Nước được coi là một trong những yếu tố quan trọng nhất ảnh hưởng đến quá trình quang hợp. Khi lượng nước giảm, khí khổng bắt đầu đóng lại để tránh mất nước trong quá trình thoát hơi nước. Khi khí khổng đóng, lượng CO2 cũng dừng lại sẽ ảnh hưởng đến quá trình quang hợp.
- Nước là nguyên liệu trực tiếp cho quá trình phân li nước trong pha sáng của quang hợp.
- Nước là môi trường duy trì điều kiện hoạt động bình thường cho toàn bộ bộ máy quang hợp hoạt động (hoạt động của enzyme)